Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRCAPQ6ZRS2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms