Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSTM1Q6UX27 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSTM1Q6UX27 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.3 ms