Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSSK4Q6SA08 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms