Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF7Q6Q0C0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF7Q6Q0C0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms