Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM88Q6PEY1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM88Q6PEY1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms