Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KANK3Q6NY19 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms