Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms