Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD1Q5VV17 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD1Q5VV17 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms