Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFI1BQ5VTD9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms