Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1TD1Q5T7N2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1TD1Q5T7N2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms