Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL12Q53G59 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL12Q53G59 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms