Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBK1Q52WX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SBK1Q52WX2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms