Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC38Q502W7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms