Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT71Q3SY84 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KRT71Q3SY84 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms