Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL40Q2TBA0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms