Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM187BQ17R55 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM187BQ17R55 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms