Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NTRK2Q16620 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK2Q16620 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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