Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNAPC1Q16533 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNAPC1Q16533 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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