Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDB1Q16531 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDB1Q16531 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
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