Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDCD2Q16342 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDCD2Q16342 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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