Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85BQ15834 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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