Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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