Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RYR3Q15413 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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