Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERBB4Q15303 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERBB4Q15303 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms