Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RAB35Q15286 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB35Q15286 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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RAB35Q15286 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB35Q15286 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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