Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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PTPAQ15257 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPAQ15257 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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