Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFRLQ15198 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms