Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKD1Q15139 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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PRKD1Q15139 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKD1Q15139 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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