Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDK3Q15120 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDK3Q15120 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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