Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3GAP1Q15042 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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