Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERPUD1Q15011 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERPUD1Q15011 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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