Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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COL19A1Q14993 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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COL19A1Q14993 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL19A1Q14993 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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COL19A1Q14993 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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COL19A1Q14993 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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COL19A1Q14993 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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COL19A1Q14993 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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