Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB39AQ14964 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39AQ14964 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39AQ14964 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39AQ14964 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39AQ14964 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB39AQ14964 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms