Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPNMBQ14956 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
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