Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD11Q14690 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD11Q14690 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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