Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3AQ14563 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3AQ14563 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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