Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIDRQ14159 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIDRQ14159 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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