Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCINQ13939 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCINQ13939 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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CCINQ13939 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCINQ13939 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCINQ13939 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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