Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A1Q13621 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A1Q13621 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms