Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NAE1Q13564 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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NAE1Q13564 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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NAE1Q13564 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NAE1Q13564 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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