Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PICALMQ13492 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PICALMQ13492 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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