Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MTA1Q13330 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MTA1Q13330 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA1Q13330 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA1Q13330 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA1Q13330 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA1Q13330 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA1Q13330 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTA1Q13330 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms