Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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PAPPAQ13219 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAPPAQ13219 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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