Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CALCOCO2Q13137 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALCOCO2Q13137 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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