Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAF3Q13114 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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TRAF3Q13114 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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