Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPS1Q13098 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GPS1Q13098 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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