Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL28Q13084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms