Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSTF3Q12996 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSTF3Q12996 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms