Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMAN2Q12907 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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