Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CKAP4Q07065 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP4Q07065 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms